قال الكاتب الصحافي جمال سلطان: إن الإعلامي إبراهيم عيسى لا يخفي تعاطفه مع الفكر الشيعي والمذهب الشيعي، وله كتابات عديدة وحلقات تليفزيونية شهيرة تروج لتراث الشيعة في هجاء صحابة رسول الله وتشويه تاريخهم.
وأضاف سلطان في مقال نشرته صحيفة "المصريون": كان إبراهيم يضع على الحائط خلف مكتبه صورة كبيرة لحسن نصر الله القيادي الشيعي اللبناني وزعيم تنظيم "حزب الله" المتهم رسميًّا من القضاء المصري بالتورط في أعمال إرهاب ضد الجيش والشرطة المصرية، ولا أدري هل رفع إبراهيم صورة نصر الله الآن أم ما زالت باقية وتتمدد لديه.
وتابع رئيس تحرير "المصريون": قد لاحظت أن إبراهيم زاد هجاؤه للأزهر في الأسابيع الأخيرة بعد مطالبة الأزهر المرجعيات الشيعية بإصدار فتوى صريحة تحرم سب الصحابة وأمهات المؤمنين.
وذكر سلطان خلال مقاله أن الدراسة النقدية للفكر الشيعي التي نشرها المفكر الإسلامي محمد عمارة على مجلة الأزهر التي يترأس تحريرها، كانت هي الدافع وراء الهجوم الذي شنه إبراهيم عيسى على عمارة.
وكتب سلطان يقول: "ويبدو أن إبراهيم تصرف بمنطق من "على رأسه بطحة" ، لأنه يهاجم محمد عمارة بصفة مستمرة ويتهمه بالتطرف ودعم الإرهاب ، رغم أن عمارة علم من أعلام الفكر الإسلامي الوسطي والمستنير في العالم الإسلامي كله ، وهو محقق وناشر تراث رفاعة الطهطاوي وقاسم أمين ومحمد عبده والأفغاني وغيرهم من الرواد ، غير أن محمد عمارة نشر مؤخرا ـ من خلال مجلة الأزهر التي يرأس تحريرها ـ دراسات نقدية للفكر الشيعي وهو ما لم يغفره له إبراهيم عيسى واعتبره تطرفا ودعا للإرهاب